Es ist unerheblich in welche Staffel die Absteiger aus der 2. Bundesliga einsortiert werden. Es steigen regulär die drei Letzten jeder Drittligastaffel ab, wobei es dieses Jahr aufgrund des Aufstiegsverzichts einiger Oberligisten zu einer Relegation der Tabellenvierzehnten kommen wird.
Wenn alle 64 Teilnehmer der 3. Liga für die Saison 2016/17 inklusive Absteigern aus der 2. Bundesliga und Aufsteigern aus den 4. Ligen feststehen, wird weitetstgehend unter geographischen Gesichtspunkten eine Einteilung in vier Staffeln zu je 16 Mannschaften vorgenommen werden.
