hallo,
in München ist die "Schwierigkeit" dass die Leistungsorientierten Vereine eher am Rande von München sind, große Namen sind Milbertshofen, Schwabing (lange her), Gröbenzell, Ismaning, Haunstetten (ok, ist schon sehr am Rand 
Wenn Du auf die BHV Seite (http://www.bhv-online.de) gehst siehst Du erstmal die Ligeneinteilung. München gehört zum Bezirk Oberbayern. Für die EJugend gibt es da nix aber ab der D-Jugend, wenn Du da mal unter Spielbetrieb und Einteilung der Jugend schaust, siehst Du einige Vereine, wo Du Dich mal erkundigen kannst.
Mein Vorschlag wäre, such Dir einen Verein der gut erreichbar ist, wo Dein Knirps auch alleine hingehen kann. Lass ihn mal spielen. Wenn Du in der "Szene drin bist, wirst Du rausfinden, welche Vereine einen Namen im Bereich der männlichen Jugend im Raum München haben, bzw. wo gut trainiert wird. In der C-Jugend findet dann eine Talentsichtung des BHV statt. Hat Dein Junge talent wird er da gefördert und dann wirst Du auf jeden Fall den verein finden, wo Dein Junge gut aufgehoben ist.
Wie Du feststellen wirst, ist aber Bayern im Allgemeinen, aber gerade München im Besonderen nicht gerade herausragend im männlichen Jugendhandball ausgestattet. Warum kann man sich denke ich denken 
Viel Glück. Und bei Fragen, melde Dich.
Grüße